L'association Centre de recherche pour élèves Lörrach-Trois Pays a été créée le 30 avril 2007 par 17 membres fondateurs. L'association poursuit l'objectif de promouvoir l'économie et la recherche et la formation des jeunes. Elle est l'organe de gestion du phaenovum. L'association est reconnue d'utilité publique du point de vue fiscal.
La coordination et la mise en place de l'association ont été réalisées par la structure Innocel Innovations-Center Lörrach GmbH (aujourd'hui WFL Wirtschaftsförderung Lörrach).
Le centre de recherche pour élèves est né de la fusion entre le TP de physique du lycée Hans-Thoma-Gymnasium, le séminaire des technologies de l'information de Lörrach (Innocel et "Steinbeis-Transferzentrum Embedded Design und Networking") avec l'aide du groupement trinational "BioValley College Networks".
Le soutien de l'Union européenne dans le cadre d'INTERREG IV du 1er mars 2009 au 30 novembre 2012 avec une aide d'un montant de 1,06 million d'euros a permis de faire du phaenovum un réseau trinational et d'adjoindre une extension au site existant. Le porteur de projet était la ville de Lörrach, tandis que la structure Innocel Innovations-Center Lörrach GmbH assumait la direction du projet.
En 2017, le phaenovum a fêté ses 10 ans d'existence et est désormais un acteur important du paysage éducatif dans la région. Grâce à ses nombreux membres et élèves utilisateurs, le phaenovum apporte une contribution essentielle pour la promotion des salariés qualifiés et la relève dans les métiers des sciences et de la technologie.
Le phaenovum est certifié selon l'AZAV depuis 2014 et peut donc réaliser des mesures pour l'agence pour l'emploi.
